現如今等離子清洗機應用于醫療領域已經不罕見了，經等離子表面清洗過后，可以進一步提升表面親水性、粘附性、生物相容性、透氣性和抗凝性能，使得通過等離子清洗機進行處理已經是生物醫學材料表面處理和清潔的有效手段之一了。它可以改善許多醫療行業內所需的器件，如軟組織材料、人血管系統材料、醫療膜材料、生物傳感器材料、骨修復和更換材料等等。

我們可以先拿導尿管做例子來說明等離子清洗機的作用，為了防止尿管中硅橡膠與人體接觸表面的老化，需要對其表面進行氧等離子的處理，以促成等離子體處理前后的表面結構、性能和化學成分的變化，而經過氧等離子體處理后的導尿管體現在表面變滑，表面性能明顯發生改變，且無有害基團產生。另外，若是在等離子清洗機處理硅橡膠增加了表面活性之后，再在表面涂度一層不易老化的疏水材料，其效果也非常好。

等離子清洗機在醫療器械中的應用，實質上就是在解決醫療器械材料的表面處理問題，以及醫療設備與人體生物相容性問題。即是保證人體在使用植入或介入醫療設備時，不會造成排異、凝血、毒性、過敏、致癌、免疫反應等，同時醫療設備與人體協調并達到預期的功能。 

像醫用輸液導管、引流管、導尿管、細胞培養皿、植入體等等，都會使用等離子清洗機的處理，在這一過程中使得羥基、羧基、氨基、環氧基團接枝引入，這不僅有助于酶的固定，而且能延長表面親水性的時間，增強醫療器械與人體的相容性，這些都使得等離子清洗機在醫療器械行業中增加了不小的影響力。